Começando com Diglett, o jogador deve jogar através de um total de 90 níveis de pinball (70 no modo Quest, e 10 em cada Time Attack e Score Attack), o objeto geralmente vai ser o de colocar uma Pokébola (servindo como pinball) em cada buraco. Ao longo do caminho, o jogador pode apanhar mais Pokémons para usar.
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